Le musée de Santa Cruz occupe un bel ensemble plateresque dont la façade est l'oeuvre de Covarrubias. À l'intérieur, le volume de la nef et du transept dessine une croix grecque sur deux niveaux. L'élégant patio plateresque et l'escalier sont remarquables. Le musée comprend une belle collection de peinture et une quinzaine de toiles du Greco qui permettent d'apprécier l'évolution stylistique du peintre.