Bien que sa construction soit l'oeuvre des chevaliers de l'ordre du Saint-Sépulcre, la chapelle de la Vraie Croix appartient aujourd'hui à l'ordre de Malte. Elle épouse un plan circulaire hérité des baptistères paléochrétiens et un couloir annulaire entoure un petit édicule composé de deux salles superposées où se déroulaient les cérémonies secrètes de l'ordre.